Зейское водохранилище играет большую роль в сдерживании паводка.
О чем говорят следующие цифры: верхний бьеф держит уровень в 318,45 м; нижний бьеф– 225,19 м.
Станция выполняет необходимый комплекс мероприятий по функционированию гидротехники Сотрудники Зейского водохранилища обмениваются информацией по состоянию уровня воды с работниками МЧС, Амурским гидрометцентром Надо отметить боевую готовность локальной системы оповещения ГЭС относительно передачи сигналов Все работы санкционируются с вышестоящими органами, существует жесткий контроль со стороны государства Они наблюдают за режимом наполнения и работой водохранилища, пропуском паводка Амура На сегодняшний день крепкая плотина Зейской ГЭС вместе с Бурейской ГЭС сдерживает почти 40% паводка Дальний Восток питается воспроизводимой здесь электроэнергией, точнее, несколько регионов, что составляет треть всей необходимой электроэнергии